Em Gray Matter você é um neurobiólogo, Dr. Styles, que após um acidente perdeu a esposa e ficou desfigurado, e assim, ficou recluso em sua casa de campo, a mansão Dread Hill.
A mansão Dread Hill é um lugar cercado de mistérios há quase um século e cabe a você descobrir o que está por trás daquele lugar. Os desafios do game, na maior marte, são armadilhas e objetos a alcançar.