Star Trek Online é inspirado na franquia que conta com filmes e diversos seriados televisivos Star Trek, veiculados em território brasileiro como Jornada nas Estrelas. Porém, ao levar em conta que o jogo se passa no ano de 2049, ou seja, 30 anos após os acontecimentos finais do último filme da franquia Star Treck, não há nenhuma conexão entre filmes, séries e o novo MMO da Cryptic.